Familia de microorganismos del dominio Bacteria, phylum Thermotogae, clase Thermotogae, orden Thermotogales.[1]
Géneros:[cita requerida]
Datos: Q6145846
Multimedia:
Especies: Thermotogaceae
Familia de microorganismos del dominio Bacteria, phylum Thermotogae, clase Thermotogae, orden Thermotogales.
Thermotogaceae — родина бактерій бактерій, термофілів або гіпертермофілів, єдина у своєму типі (Thermotoga). Їх клітини окутані набагато більшою зовнішнію мембраною, «тогою». Вони засвоюють вуглеводи. Види мають різну толерантність до концентрації солі і кисню.
Наприклад, T. subterranea SL1 була знайдена при температурі 70 °C в глибокому континентальному резервуарі нафти в Східному паризькому резервуарі (Франція). Ці бактерії анаероби і відновлюють цистеїн і тіосульфати до сульфіду водню.
Структура білків цих бактерій викликає інтерес завдяки їх можливостям діяти в умовах дуже високих температур. Це також одна з причин, чому вони спочатку була прийняти за архей, багато з яких також є гіпертермофілами.
Thermotogaceae Reysenbach 2002
Термотоговые[1] (лат. Thermotogaceae) — единственное семейство бактерий из одноимённых типа и класса термотог[2][3][4] (Thermotogae). Грамотрицательные анаэробные, в основном термофильные и гипертермофильные микроорганизмы[5]. Название типового рода Thermotoga, от которого произошли названия более высоких таксонов, отражает его существование при высоких температурах, вкупе с характерной, похожей на футляр структурой, называемой «тога», окружающей клетки этих видов[6].
Несмотря на то, что виды Thermotogaceae отрицательно окрашиваются по Граму, они окружены одной липидной мембраной, являясь таким образом монодермными бактериями[7][8]. Относительно недавно были обнаружены представители Thermotogaceae, существующие при мезофильных температурах[9].
Семейство термотоговых — единственный представитель порядка Thermotogales, также единственного в типе и классе Thermotogae. На июль 2015 г. семейство включает 10 родов[10]:
Ещё один род входит в семейство по данным NCBI: Thermopallium Duckworth et al. 1996[11].
Было обнаружено, что на филогенетическом дереве, построенном на основании последовательностей 16S рРНК, Thermotogae ответвляются вместе с Aquificae (ещё одним типом, состоящим из гипертермофильных организмов) поблизости от точки разветвления бактерий и архей[5][6]. Однако, глубокие родственные связи между Thermotogae и Aquificae, также как и раннее ответвление последних, не подтверждаются филогенетическими исследованиями, основанными на сравнении последовательностей других генов и белков[12][13][14][15], а также консервативных таксонспецифических инделов (вставок и делеций) в нескольких высококонсервативных повсеместно встречающихся белках[16]. Thermotogae также привлекли внимание ученых благодаря сообщениям о вероятном очень значительном горизонтальном переносe генов между этими бактериями и археями[17][18]. Однако, недавние исследования, основанные на более надёжных методиках, показывают, что случаи горизонтального переноса генов между Thermotogae и другими группами, включая Archaea, не настолько распространены, как предполагалось в ранних исследованиях[19][20][21][22].
До недавнего времени не было известно каких-либо биохимических или молекулярно-генетических маркеров, которые отличали бы виды типа Thermotogae от всех других бактерий[5]. Однако, недавний сравнительный геномный анализ выявил большое количество консервативных таксонспецифичных инделов (вставок и делеций) («сonserved signature indel», CSIs) в важных белках, сспецифичных либо для всего типа Thermotogae, либо для некоторых из его подгрупп[21].
Восемнадцать из этих консервативных инделов в таких важных для жизнедеятельности белках, как Pol1, RecA, TrpRS и рибосомных белках L4, L7/L12, S8, S9 и т. д. — уникальны и присутствуют во всех видах Thermotogaceae, чей геном был секвенирован. Кроме того, эти исследования также выявили 14 консервативных инделов специфичных для клады, включающей роды Fervidobacterium и Thermosipho, 12 консервативных инделов специфичных для рода Thermotoga (кроме Thermotoga lettingae) и 8 консервативных инделов, могущих служить молекулярными маркерами для видов рода Thermosipho[21].
Также, существование отдельной клады, состоящей из рано ответвляющихся от основного ствола филогенетического дерева видов Petrotoga mobilis, Kosmotoga olearia и Thermotogales bacterium mesG1, обосновано наличием 7 консервативных инделов общих для этих видов[21]. Кроме того, авторы сообщают, что некоторые CSI подтверждают данные о горизонтальном переносе генов между Thermotogae и другими группами прокариот[21].
Принятая на сегодня таксономия основана на List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[10][23] и филогения соответствует основанному на последовательностях 16S рРНК выпуску The All-Species Living Tree Project 111[24].
?Caldotoga fontana ♥ Xue et al. 1999
?Mesotoga prima Nesbo et al. 2013
?Thermopallium natronophilum ♠ Duckworth et al. 1996
?T. katamachii ♥ Takahata et al. 2000
?T. kuroii ♥ Takahata et al. 2000
T. naphthophila Takahata et al. 2001
T. petrophila Takahata et al. 2001
T. maritima Stetter and Huber 1986 (type sp.)
T. neapolitana Jannasch et al. 1989
T. hypogea Fardeau et al. 1997
T. thermarum Windberger et al. 1992
T. subterranea Jeanthon et al. 2000
T. elfii Ravot et al. 1995
T. lettingae Balk et al. 2002
?F. pennivorans Friedrich and Antranikian 1999
F. changbaicum Cai et al. 2007
F. islandicum Huber et al. 1991
F. nodosum Patel et al. 1985 (type sp.)
F. gondwanense Andrews and Patel
F. riparium Podosokorskaya et al. 2011
?T. ferriphilus ♠ Kendall et al. 2002
T. geolei L'Haridon et al. 2001
T. atlanticus Urios et al. 2004
T. affectus Podosokorskaya et al. 2011
T. melanesiensis Antoine et al. 1997
T. globiformans Kuwabara et al. 2011
T. africanus Huber et al. 1989 emend. Ravot et al. 1996 (type sp.)
T. japonicus Takai and Horikoshi 2000
Kosmotoga arenicorallina Nunoura et al. 2011
Kosmotoga olearia DiPippo et al. 2009 (type sp.)
Thermococcoides shengliensis Feng et al. 2010
M. hydrogenitolerans Postec et al. 2005
M. litoralis Postec et al. 2010
M. okinawensis Nunoura et al. 2007
M. piezophila Alain et al. 2002
M. camini Wery et al. 2001 (type sp.)
Oceanotoga teriensis Jayasinghearachchi and Lal 2011
?G. aestuarianus ♠ Holton et al. 2002
G. petraea Davey et al. 1993 (type sp.)
G. subterranea Davey et al. 1993
Defluviitoga tunisiensis Ben Hania et al. 2012
P. sibirica L'Haridon et al. 2002
P. olearia L'Haridon et al. 2002
P. mexicana Miranda-Tello et al. 2004
P. mobilis Lien et al. 1998
P. halophila Miranda-Tello et al. 2007
P. miotherma Davey et al. 1993 (type sp.)
Примечания:
♠ Штамм найден в National Center for Biotechnology Information NCBI, но не обозначен в List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
♥ Штамм отсутствует в National Center for Biotechnology Information NCBI, но обозначен в List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
Из-за своей способности хорошо себя чувствовать при высоких температурах некоторые виды Thermotogaceae рассматриваются в качестве привлекательных кандидатов для использования в промышленных процессах[25]. Способность Thermotogaceae в процессе метаболизма использовать различные сложные углеводороды, выделяя при этом газообразный водород приводит к тому, что эти виды упоминаются в качестве возможного биотехнологического источника энергии, альтернативного ископаемому топливу[26].
Термотоговые (лат. Thermotogaceae) — единственное семейство бактерий из одноимённых типа и класса термотог (Thermotogae). Грамотрицательные анаэробные, в основном термофильные и гипертермофильные микроорганизмы. Название типового рода Thermotoga, от которого произошли названия более высоких таксонов, отражает его существование при высоких температурах, вкупе с характерной, похожей на футляр структурой, называемой «тога», окружающей клетки этих видов.
Несмотря на то, что виды Thermotogaceae отрицательно окрашиваются по Граму, они окружены одной липидной мембраной, являясь таким образом монодермными бактериями. Относительно недавно были обнаружены представители Thermotogaceae, существующие при мезофильных температурах.
