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Methanocaldococcus ( German )

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Methanocaldococcus ist taxonomisch eine Gattung prokaryotischer Mikroorganismen.[1] Methanocaldococcus gehört zur Domäne der Lebewesen Archaea und ist ein Methanbildner.[2]

Alle Arten in Methanocaldococcus sind methanogene Mikroorganismen. Sie verwenden Wasserstoff, um Kohlendioxid zu reduzieren. Im Gegensatz zu vielen anderen Arten in der Abteilung Euryarchaeota können sie kein Formiat, Acetat, Methanol oder Methylamin als Substrat verwenden. Fast alle Methanocaldococcus-Arten sind mesophil, mit Ausnahme des thermophilen M. thermolithotrophicus und des hyperthermophilen M. jannaschii.[3] Letzterer wurde an der Basis eines „weißen Rauchers“ auf dem Ostpazifischen Rücken entdeckt[4] und es war das erste Archaeen-Genom, das vollständig sequenziert wurde.[5]

Systematik

Die Beschreibungen der Gattung und der Familie erfolgten durch Veröffentlichungen, die durch die Internationale Vereinigung der Mikrobiologischen Gesellschaften (IUMS) anerkannt und dadurch zu sogenannten effektiven Veröffentlichungen wurden:

  • Whitman (2001) — Effektive Veröffentlichung zur Gattung Methanocaldococcus.[2]
  • Whitman et al. (2001) — Effektive Veröffentlichung zur Familie Methanocaldococcacae.[6]
  • IUMS (2002) — Validierungsliste Nummer 85, offizielle Veröffentlichung der Internationalen Vereinigung der Mikrobiologischen Gesellschaften (IUMS) zur Gültigmachung von Namen, u. a. für die Familie (Methanocaldococcaceae WHITMAN et al. 2002) und die Gattung (Methanocaldococcus WHITMAN 2002).[1]

Anzumerken ist, dass die Vertreter der Gattung Methanocaldococcus, die bei Inkrafttreten bereits beschrieben waren, zuvor in der Gattung Methanococcus standen. So hieß beispielsweise M. jannaschii vor 2002 offiziell Methanococcus jannaschii und ab 2002 Methanocaldococcus jannaschii.

Datenbanken

Einzelnachweise

  1. a b International Union of Microbiological Societies: VALIDATION LIST No. 85; Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. In: International journal of systematic and evolutionary microbiology. Band 52, Mai 2002, S. 685–690, doi:10.1099/00207713-52-3-685, PMID 12054225.
  2. a b W. B. Whitman: Genus I. Methanocaldococcus gen. nov. In: David R. Boone, Richard W. Castenholz, George M. Garrity (Hrsg.): Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology. Second edition Auflage. Volume one: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. Springer Verlag, New York 2001, S. 243–245, doi:10.1007/978-0-387-21609-6.
  3. George M. Garrity, John G. Holt, William B. Whitman, Jyoti Keswani, David R. Boone, Yosuke Koga, et al.: Phylum AII. Euryarchaeota phy. nov. In: David R. Boone, Richard W. Castenholz, George M. Garrity (Hrsg.): Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology. Volume 1: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. Springer, New York, NY 2001, doi:10.1007/978-0-387-21609-6_17.
  4. W. J. Jones, J. A. Leigh, F. Mayer, C. R. Woese, R. S. Wolfe: Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent. In: Archives of Microbiology. 136, 1983, S. 254, doi:10.1007/BF00425213.
  5. C. J. Bult, O. White, G. J. Olsen, L. Zhou, R. D. Fleischmann, G. G. Sutton, J. A. Blake, L. M. FitzGerald, R. A. Clayton, J. D. Gocayne, A. R. Kerlavage, B. A. Dougherty, J. F. Tomb, M. D. Adams, C. I. Reich, R. Overbeek, E. F. Kirkness, K. G. Weinstock, J. M. Merrick, A. Glodek, J. L. Scott, N. S. Geoghagen, J. C. Venter: Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii. In: Science. Band 273, Nummer 5278, August 1996, S. 1058–1073, PMID 8688087.
  6. W. B. Whitman, D. R. Boone, Y. Koga: Family II. Methanocaldococcaceae fam. nov. In: David R. Boone, Richard W. Castenholz, George M. Garrity (Hrsg.): Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology. Second edition Auflage. Volume one: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. Springer Verlag, New York 2001, S. 242–243, doi:10.1007/978-0-387-21609-6.
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Methanocaldococcus: Brief Summary ( German )

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Methanocaldococcus ist taxonomisch eine Gattung prokaryotischer Mikroorganismen. Methanocaldococcus gehört zur Domäne der Lebewesen Archaea und ist ein Methanbildner.

Alle Arten in Methanocaldococcus sind methanogene Mikroorganismen. Sie verwenden Wasserstoff, um Kohlendioxid zu reduzieren. Im Gegensatz zu vielen anderen Arten in der Abteilung Euryarchaeota können sie kein Formiat, Acetat, Methanol oder Methylamin als Substrat verwenden. Fast alle Methanocaldococcus-Arten sind mesophil, mit Ausnahme des thermophilen M. thermolithotrophicus und des hyperthermophilen M. jannaschii. Letzterer wurde an der Basis eines „weißen Rauchers“ auf dem Ostpazifischen Rücken entdeckt und es war das erste Archaeen-Genom, das vollständig sequenziert wurde.

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Methanocaldococcus

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Methanocaldococcus formerly known as Methanococcus is a genus of coccoid methanogen archaea.[1] They are all mesophiles, except the thermophilic M. thermolithotrophicus and the hyperthermophilic M. jannaschii. The latter was discovered at the base of a “white smoker” chimney at 21°N on the East Pacific Rise[2] and it was the first archaean genome to be completely sequenced, revealing many novel and eukaryote-like elements.[3]

Nomenclature

The name Methanocaldococcus has Latin and Greek roots, methano for methane, caldo for hot, and the Greek kokkos for the spherical shape of the cells. Overall, the name means spherical cell that produces methane at hot temperatures.[4]

Metabolism

All species in Methanocaldococcus are obligate methanogens. They use hydrogen to reduce carbon dioxide. Unlike many other species within Euryarchaeota, they cannot use formate, acetate, methanol or methylamines as substrates.[4]

Phylogeny

The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [5] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[6]

See also

References

  1. ^ See the NCBI webpage on Methanocaldococcus. Data extracted from the "NCBI taxonomy resources". National Center for Biotechnology Information. Retrieved 2007-03-19.
  2. ^ W.J. Jones; et al. (December 1983). "Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent". Arch. Microbiol. 136 (4): 254–261. doi:10.1007/BF00425213. S2CID 33277659.
  3. ^ C.J. Bult; et al. (August 1996). "Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii". Science. 273 (5278): 1058–1073. Bibcode:1996Sci...273.1058B. doi:10.1126/science.273.5278.1058. PMID 8688087. S2CID 41481616.
  4. ^ a b David R. Boone; Richard W. Castenholz, eds. (2012-01-13). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1 (2 ed.). Nueva York: Springer Science and Business Media. p. 243. doi:10.1007/978-0-387-21609-6. ISBN 978-1-4419-3159-7. S2CID 41426624. Retrieved 2016-07-27.
  5. ^ J.P. Euzéby. "Methanococcales". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archived from the original on 2013-01-27. Retrieved 2011-11-17.
  6. ^ Sayers; et al. "Methanococcales". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2011-06-05.
  7. ^ "The LTP". Retrieved 23 February 2022.
  8. ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2022.
  9. ^ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2022.
  10. ^ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  11. ^ "ar53_r207.sp_labels". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  12. ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
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Methanocaldococcus: Brief Summary

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Methanocaldococcus formerly known as Methanococcus is a genus of coccoid methanogen archaea. They are all mesophiles, except the thermophilic M. thermolithotrophicus and the hyperthermophilic M. jannaschii. The latter was discovered at the base of a “white smoker” chimney at 21°N on the East Pacific Rise and it was the first archaean genome to be completely sequenced, revealing many novel and eukaryote-like elements.

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Methanocaldococcus ( Spanish; Castilian )

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Methanocaldococcus, antiguamente conocido como Methanococcus, es un género de arqueas metanógenas en forma de coco.[1]​ Todas son mesófilos, excepto M. thermolithotrophicus que es termófilo y M. jannaschii que es hipertermófilo. Este último se descubrió en la base de la chimenea de un hábitos blanco a 21°N en el Dorsal del Pacífico Oriental.[2]​ La suya fue el primer genoma de cualquier archaea en ser secuenciado en su totalidad, revelando muchos elementos novedosos y similitudes con los genomas eucarióticas.[3]

Nomenclatura

El nombre Methanocaldococcus tiene raíces latinos y griegos, methano por metano, caldo por caliente, y el griego kokkos para célula esférica. En todo, es célula esférica que produce metano a temperaturas altas.[4]

Metabolismo

Todas de las especies de Methanocaldococcus son metanógenas obligadas. Usan hidrógeno para reducir el dióxido de carbono. A diferencia de unas otras especies de Euryarchaeota, no pueden utilizar formiato, acetato, metanol o metilaminas como sustratos.[4]

Referencias

  1. NCBI página sobre Methanocaldococcus. Datos extraídos de «NCBI taxonomy resources». Centro Nacional para la Información Biotecnológica. Consultado el 19 de marzo de 2007.
  2. W.J. Jones (diciembre de 1983). «Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent». Arch. Microbiol. 136 (4): 254-261. doi:10.1007/BF00425213.
  3. C.J. Bult (agosto de 1996). «Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii». Science 273 (5278): 1058-1073. PMID 8688087. doi:10.1126/science.273.5278.1058.
  4. a b David R. Boone; Richard W. Castenholz, eds. (13 de enero de 2012). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 1 (2 edición). Nueva York: Springer Science and Business Media. p. 243. ISBN 978-1-4419-3159-7. doi:10.1007/978-0-387-21609-6. Consultado el 27 de julio de 2016.

Otras lecturas

Revistas científicas

Libros científicos

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Methanocaldococcus: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Methanocaldococcus, antiguamente conocido como Methanococcus, es un género de arqueas metanógenas en forma de coco.​ Todas son mesófilos, excepto M. thermolithotrophicus que es termófilo y M. jannaschii que es hipertermófilo. Este último se descubrió en la base de la chimenea de un hábitos blanco a 21°N en el Dorsal del Pacífico Oriental.​ La suya fue el primer genoma de cualquier archaea en ser secuenciado en su totalidad, revelando muchos elementos novedosos y similitudes con los genomas eucarióticas.​

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Methanocaldococcus ( French )

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Methanocaldococcus est un genre d'archées méthanogènes thermophiles de la famille des Methanocaldococcaceae.

Notes et références

  1. (en) Référence NCBI : Methanocaldococcus (taxons inclus)
  • (en) WB Whitman, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, New York, Springer Verlag, 2001 (ISBN 978-0-387-98771-2), « Genus I. Methanocaldococcus gen. nov. »
  • (en) Whitman WB, Boone DR, Koga Y, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, New York, Springer Verlag, 2001 (ISBN 978-0-387-98771-2), « Family II. Methanocaldococcaceae fam. nov. »

Liens taxinomiques :

  • (en) Methanocaldococcus
  • (en) Methanocaldococcus
  • (en) Methanocaldococcus
  • (en) Methanocaldococcus
  • (en) Methanocaldococcus
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Methanocaldococcus: Brief Summary ( French )

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Methanocaldococcus est un genre d'archées méthanogènes thermophiles de la famille des Methanocaldococcaceae.

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Methanocaldococcus ( Russian )

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Класс: Methanococci Boone 2002
Порядок: Methanococcales
Семейство: Methanocaldococcaceae
Род: Methanocaldococcus
Международное научное название

Methanocaldococcus Whitman 2002

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Methanocaldococcus (лат.) — род архей из семейства Methanocaldococcaceae порядка Methanococcales[1].

Коккоидные метаногены. Мезофилы, за исключением вида Methanocaldococcus jannaschii, являющегося гипертермофилом.

Классификация

На июнь 2017 года в род включают 7 видов[2][1]:

Примечания

  1. 1 2 Taxonomy Browser : Methanocaldococcus : [англ.] // NCBI. (Проверено 12 июля 2017).
  2. Genus Methanocaldococcus : [англ.] // LPSN. (Проверено 12 июля 2017).


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Коккоидные метаногены. Мезофилы, за исключением вида Methanocaldococcus jannaschii, являющегося гипертермофилом.

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