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Dinodnavirus

Dinodnavirus ( германски )

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Weitere FE-SEM-Aufnahmen von HcDNAV-Virionen und virusinfizierten Zellen von Heterocapsa circularisquama. (K) Eine lysierte ganze Zelle von H. circularisquama. Sichtbar sind die Organellen (o) des Zytoplamas als auch die Viroplasmen (v). (L) Höhere Vergrößerung des weiß umrandeten Bereichs in (K), der Virionen im Viroplasma zeigt. Viele Viruspartikel haben keine exakt ikosaedrische Formen, sondern sind mit dem Vorsprung bei dem sich bildenden Scheitelpunkt (Vertex) ausgestattet. Außerdem sind faserige Materialien (Pfeilspitzen) vorhanden. (M) Höhere Vergrößerung des gestrichelt umrandeten Bereichs in (K), eine Nahaufnahme unreifer Virionen im Viroplasma zeigend. Abkürzungen: m − von der Wirtszelle ausgeschiedener Schleim, o – zytoplasmatische Organellen, s – Körperschuppen (englisch body scales) der Wirtszelle, charakteristisch für H. circularisquama, v – Viroplasma.

Dinodnavirus ist eine Gattung der Viren, deren Mitglieder Dinoflagellaten infizieren.[2] Die Gattung ist mit Stand April 2019 nicht klassifiziert[1]. Es handelt sich möglicherweise um Vertreter des Phylums Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV) mit Riesen- und Pockenviren. Der Name ist von dino für Dinoflagellat und DNA abgeleitet. Die (monotypische) Typ-Spezies ist das Heterocapsa circularisquama DNA virus 01 (HcDNAV, früher HcV).[3]

Virologie

Das Virus besitzt ein icosahedrales Kapsid mit etwa 200 nm Durchmesser. Sein Genom besteht aus einer ds-DNA von einer Größe von ca. 356 kb. Das Virus infiziert das Dinoflagellatum Heterocapsa circularisquama (Dinoflagellaten: Peridiniales). Während der Replikation entstehen Virionen aus einem Teil des Zytoplasmas, dem sogenannten Viroplasma, das vom Virus erzeugt wird.[4]

Taxonomie

Es gibt derzeit noch keine vom ICTV bestätigte Einordnung dieser Gattung (Stand April 2020). Die Typ-Spezies wurde ursprünglich der Familie Phycodnaviridae (heute in der Ordnung: Algavirales, Klasse Megaviricetes innerhalb der NCLDV) zugeordnet. Untersuchungen des Genoms der Dinodnaviren haben aber gezeigt, dass die Gattung eher zur Familie Asfarviridae (heute in der Ordnung Asfuvirales, Klasse Pokkesviricetes) gehört,[5] ähnlich wie die vorgeschlagenen TaxaFaustovirus“, „Pacmanvirus“ und „Kaumoebavirus“. Näheres siehe Faustovirus“ §Äußere Systematik.

Einzelnachweise

  1. a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. K. Tarutani, K. Nagasaki, S. Itakura, M. Yamaguchi: Isolation of a virus infecting the novel shellfish-killing dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. In: Aquat Microb Ecol. 23, 2001, S. 103–111.
  3. Mohammadreza Sadeghi, Yuji Tomaru, Tero Ahola: RNA Viruses in Aquatic Unicellular Eukaryotes, in: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 3, Special Issue Viruses of Microbes 2020: The Latest Conquests on Viruses of Microbes, 362;doi:10.3390/v13030362
  4. K. Nagasaki, Y. Tomaru, K. Tarutani, N. Katanozaka, S. Yamanaka, H. Tanabe, M. Yamaguchi: Growth characteristics and intraspecies host specificity of a large virus infecting the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. In: Applied and Environmental Microbiology. Band 69, Nummer 5, Mai 2003, S. 2580–2586, doi:10.1128/aem.69.5.2580-2586.2003, PMID 12732524, PMC 154496 (freier Volltext).
  5. H. Ogata, K. Toyoda, Y. Tomaru, N. Nakayama, Y. Shirai, J. M. Claverie, K. Nagasaki: Remarkable sequence similarity between the dinoflagellate-infecting marine girus and the terrestrial pathogen African swine fever virus. In: Virol J. 6, 2009, S. 178.
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Dinodnavirus: Brief Summary ( германски )

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Dinodnavirus ist eine Gattung der Viren, deren Mitglieder Dinoflagellaten infizieren. Die Gattung ist mit Stand April 2019 nicht klassifiziert. Es handelt sich möglicherweise um Vertreter des Phylums Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV) mit Riesen- und Pockenviren. Der Name ist von dino für Dinoflagellat und DNA abgeleitet. Die (monotypische) Typ-Spezies ist das Heterocapsa circularisquama DNA virus 01 (HcDNAV, früher HcV).

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Dinodnavirus ( англиски )

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Dinodnavirus is a genus of viruses that infect dinoflagellates.[1] This genus belongs to the clade of nucleocytoplasmic large DNA viruses. The name is derived from 'dino' (dinoflagellate) and DNA (from its genome).

The only species in the genus is Heterocapsa circularisquama DNA virus 01.[2]

Virology

The virus has an icosahedral capsid ~200 nanometers in diameter.

The genome is a single molecule of double stranded DNA of a ~356-kilobases.

It infects the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama.

During replication virions emerge from a specific cytoplasm compartment – the 'viroplasm' – which is created by the virus.[3]

Taxonomy

The sole species was originally thought to belong to the family Phycodnaviridae. DNA studies have shown that it belongs in the family Asfarviridae.[4][5]

References

  1. ^ Tarutani K, Nagasaki K, Itakura S, Yamaguchi M (2001) Isolation of a virus infecting the novel shellfish-killing dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. Aquat Microb Ecol 23:103–111
  2. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 24 May 2021.
  3. ^ Nagasaki K, Tomaru Y, Tarutani K, Katanozaka N, Yamanaka S, Tanabe H, Yamaguchi M (2003) Growth characteristics and intraspecies host specificity of a large virus infecting the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. Appl Environ Microbiol 69:2580–2586
  4. ^ Ogata H, Toyoda K, Tomaru Y, Nakayama N, Shirai Y, Claverie JM, Nagasaki K (2009) Remarkable sequence similarity between the dinoflagellate-infecting marine girus and the terrestrial pathogen African swine fever virus. Virol J 6:178
  5. ^ Karki, Sangita; Moniruzzaman, Mohammad; Aylward, Frank O. (2021). "Comparative Genomics and Environmental Distribution of Large dsDNA Viruses in the Family Asfarviridae". Frontiers in Microbiology. 12: 657471. doi:10.3389/fmicb.2021.657471. PMC 8005611. PMID 33790885.
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Dinodnavirus: Brief Summary ( англиски )

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Dinodnavirus is a genus of viruses that infect dinoflagellates. This genus belongs to the clade of nucleocytoplasmic large DNA viruses. The name is derived from 'dino' (dinoflagellate) and DNA (from its genome).

The only species in the genus is Heterocapsa circularisquama DNA virus 01.

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Dinodnavirus ( руски )

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Семейство: incertae sedis
Род: Dinodnavirus
Международное научное название

Dinodnavirus

Единственный вид
  • Heterocapsa circularisquama DNA virus 01
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Систематика
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NCBI 1232647EOL 33447797

Dinodnavirus (лат.) — род вирусов, инфицирующих динофлагеллят[2]. Род принадлежит к кладе крупных ядерно-цитоплазматических ДНК-содержащих вирусов. Название рода происходит от dino (динофлагелляты) и DNA (ДНК, по вирусному геному). Единственный представитель рода — Heterocapsa circularisquama DNA virus 01.

Описание

Вирус имеет икосаэдровый капсид, размер около 200 нм в диаметре. Геном — двуцепочечная ДНК длиной около 356 Кб. Инфицирует динофлагеллят Heterocapsa circularisquama[en]. При репликации вирионы появляются из особого цитоплазматического компартмента вироплазмы, которая образуется вирусом[3].

Таксономия

Таксономическое положение рода не ясно. Изначально род был помещён в семейство Phycodnaviridae, однако, анализ ДНК показал, что род ближе к семейству Asfarviridae[4].

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Tarutani K., Nagasaki K., Itakura S., Yamaguchi M. (2001). Isolation of a virus infecting the novel shellfish-killing dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. Aquat Microb Ecol 23: 103—111.
  3. Nagasaki K., Tomaru Y., Tarutani K., Katanozaka N., Yamanaka S., Tanabe H., Yamaguchi M. (2003). Growth characteristics and intraspecies host specificity of a large virus infecting the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. Appl Environ Microbiol 69: 2580—2586.
  4. Ogata H., Toyoda K., Tomaru Y., Nakayama N., Shirai Y., Claverie J. M., Nagasaki K. (2009). Remarkable sequence similarity between the dinoflagellate-infecting marine girus and the terrestrial pathogen African swine fever virus. Virol J 6: 178.
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Dinodnavirus: Brief Summary ( руски )

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Dinodnavirus (лат.) — род вирусов, инфицирующих динофлагеллят. Род принадлежит к кладе крупных ядерно-цитоплазматических ДНК-содержащих вирусов. Название рода происходит от dino (динофлагелляты) и DNA (ДНК, по вирусному геному). Единственный представитель рода — Heterocapsa circularisquama DNA virus 01.

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